這是一個(gè)在分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室中非常核心的問題。普通凝膠成像、化學(xué)發(fā)光成像和多色熒光成像是三種不同原理和應(yīng)用的成像技術(shù),它們的區(qū)別主要在于檢測(cè)對(duì)象、成像原理、系統(tǒng)配置和應(yīng)用場(chǎng)景。
下面進(jìn)行核心對(duì)比,然后詳細(xì)解釋:
一、普通凝膠成像、化學(xué)發(fā)光凝膠成像、多色熒光凝膠成像比較
1、普通凝膠成像
(1)主要檢測(cè)對(duì)象:核酸(DNA/RNA)
(2)標(biāo)記物/染料:EB、GelRed、SYBR 等(嵌入雙鏈)
(3)成像原理 :核酸(DNA/RNA)
(4)光源 :紫外透射/反射儀,或白光儀
(5)濾光片 :需要(紫外濾光片或特定波段濾光片)
(6)靈敏度:中(ng級(jí))
(7)主要應(yīng)用:DNA/RNA瓊脂糖凝膠電泳(核酸大小、含量)
(8)優(yōu)點(diǎn):簡(jiǎn)單、快速、成本低
(9)缺點(diǎn):靈敏度有限,通常只能看單一樣品,核酸染料多有毒性
2、化學(xué)發(fā)光成像
(1)主要檢測(cè)對(duì)象:蛋白質(zhì)(居多)或核酸
(2)標(biāo)記物/染料:酶(HRP/AP) + 化學(xué)發(fā)光底物
(3)成像原理:無(wú)需激發(fā)光! 酶催化底物產(chǎn)生自身化學(xué)發(fā)光
(4)光源:無(wú)需光源,或僅需微弱光用于對(duì)焦
(5)濾光片:通常不需要,或使用寬范圍濾光片收集所有光
(6)靈敏度:高(pg甚至fg級(jí))
(7)主要應(yīng)用:Western Blot(蛋白免疫印跡), Northern/Southern Blot
(8)優(yōu)點(diǎn):靈敏度高,動(dòng)態(tài)范圍寬,無(wú)需激發(fā)光無(wú)光漂白
(9)缺點(diǎn):信號(hào)不穩(wěn)定(隨時(shí)間衰減),無(wú)法進(jìn)行多重檢測(cè)
3、多色熒光成像
(1)主要檢測(cè)對(duì)象:蛋白質(zhì)、核酸等,可多重檢測(cè)
(2)標(biāo)記物/染料:熒光染料(如Cy2, Cy3, Cy5) 或 熒光蛋白
(3)成像原理:特定波長(zhǎng)激光/LED激發(fā),檢測(cè)發(fā)射光
(4)光源:高強(qiáng)度激光或多波段LED光源
(5)濾光片:需要與熒光染料匹配的激發(fā)/發(fā)射濾光片組
(6)靈敏度:高(pg級(jí)),但通常略低于高級(jí)化學(xué)發(fā)光
(7)主要應(yīng)用:Western Blot多重檢測(cè), 熒光雙向電泳(2D-DIGE), 熒光核酸膠
(8)優(yōu)點(diǎn):可同時(shí)檢測(cè)多個(gè)目標(biāo),定量更準(zhǔn),線性范圍更寬
(9)缺點(diǎn):設(shè)備昂貴,熒光染料可能相互干擾(光譜重疊),有光漂白
二、普通凝膠成像、化學(xué)發(fā)光凝膠成像、多色熒光凝膠成像詳細(xì)介紹
1、普通凝膠成像
(1)核心:主要用于核酸電泳后,對(duì)染了色的DNA/RNA條帶進(jìn)行觀察和拍照。
(2)過(guò)程:在制膠或電泳后,加入能嵌入核酸雙鏈的染料(如EB, 或更安全的SYBR Safe)。在紫外光(302nm或365nm) 照射下,這些染料被激發(fā),發(fā)出可見光(如橙色),從而顯示出條帶的位置和亮度。
(3)系統(tǒng):通常是一個(gè)暗箱,內(nèi)含紫外透射儀(光從下面照上來(lái))和/或反射儀(光從上面照下來(lái)),以及一個(gè)CCD相機(jī)和相應(yīng)的濾光片(用于過(guò)濾紫外光,保護(hù)相機(jī)并提高對(duì)比度)。
(4)簡(jiǎn)單理解:就像用“驗(yàn)鈔燈"照一張?zhí)厥獾摹板X"(凝膠),讓上面的“防偽圖案"(核酸條帶)顯現(xiàn)出來(lái)。
2、化學(xué)發(fā)光成像
(1)核心:主要用于蛋白免疫印跡(Western Blot),實(shí)現(xiàn)超高靈敏度的蛋白檢測(cè)。
(2)過(guò)程:一抗識(shí)別目標(biāo)蛋白后,用偶聯(lián)了辣根過(guò)氧化物酶(HRP) 的二抗進(jìn)行結(jié)合。加入化學(xué)發(fā)光底物(如魯米諾)后,HRP催化底物氧化,產(chǎn)生不穩(wěn)定的中間體,當(dāng)其衰減回基態(tài)時(shí)會(huì)發(fā)出光子。這個(gè)光是底物自身化學(xué)反應(yīng)產(chǎn)生的,不需要外界光源激發(fā)。
(3)系統(tǒng):需要一個(gè)高度靈敏的CCD或sCMOS相機(jī)(因?yàn)楣庑盘?hào)非常微弱),并放置在全黑的暗箱中。它通常沒有激發(fā)光源,或者只有非常弱的光用于對(duì)焦。相機(jī)會(huì)長(zhǎng)時(shí)間曝光(數(shù)秒到數(shù)分鐘)來(lái)收集這些光子。
(4)簡(jiǎn)單理解:就像觀察一群螢火蟲(化學(xué)發(fā)光反應(yīng)) 在黑暗中的閃爍。相機(jī)只是被動(dòng)地記錄它們自己發(fā)出的光。
3、多色熒光成像
(1)核心:可用于蛋白和核酸檢測(cè),其優(yōu)勢(shì)是能夠在同一張膜或同一塊膠上同時(shí)檢測(cè)多個(gè)不同的目標(biāo)分子。
(2)過(guò)程:使用能發(fā)出不同顏色光的熒光染料(如Cy3發(fā)綠光,Cy5發(fā)紅光)來(lái)標(biāo)記二抗或核酸探針。用特定波長(zhǎng)的激發(fā)光(如綠激光)去照射,熒光染料被激發(fā)后,會(huì)發(fā)射出波長(zhǎng)更長(zhǎng)、顏色不同的光。
(3)系統(tǒng):需要強(qiáng)大的激發(fā)光源(如激光或多波段LED),以及一套精密的濾光片輪。每個(gè)熒光染料都需要其專屬的“激發(fā)濾光片-發(fā)射濾光片"組合,以確保只檢測(cè)到該染料的信號(hào)而排除其他染料的干擾和背景光。
(4)簡(jiǎn)單理解:就像在一個(gè)黑暗房間里,用不同顏色的手電筒(激發(fā)光) 去照射不同的熒光貼紙(熒光染料),每種貼紙被特定顏色的手電筒照到后,會(huì)發(fā)出另一種特定顏色的光,用相應(yīng)的“有色眼鏡(濾光片)"去看,就能區(qū)分它們。
三、如何選擇?
1、看核酸膠,做常規(guī)鑒定 → 選普通凝膠成像。
2、做Western Blot,檢測(cè)極微量蛋白,追求高靈敏度 → 選化學(xué)發(fā)光成像。
3、做Western Blot或其它實(shí)驗(yàn),需要同時(shí)看目標(biāo)蛋白、內(nèi)參蛋白、磷酸化狀態(tài)等多個(gè)指標(biāo),追求精準(zhǔn)共定位和定量 → 選多色熒光成像。
現(xiàn)代的高級(jí)成像系統(tǒng)通常集成了以上所有功能:它既有紫外/白光光源用于普通凝膠成像,也有高靈敏度冷CCD和暗箱用于化學(xué)發(fā)光成像,還配備了激光器和濾光片輪用于多色熒光成像,成為一臺(tái)多功能一體機(jī)。